Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	RNU6-617P-201	ENST00000516147	107 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-473P-201	ENST00000516164	107 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-1049P-201	ENST00000516414	107 nt	BASIC	0.4	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-957P-201	ENST00000363652	99 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNORA50A-201	ENST00000384225	134 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-291P-201	ENST00000384720	107 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	U6.100-201	ENST00000636230	99 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	MIR4315-1-201	ENST00000636800	73 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	MIR4315-2-201	ENST00000640925	73 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SYCP2-202	ENST00000371001	5479 nt	APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNA5SP517-201	ENST00000364724	117 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-1327P-201	ENST00000365302	105 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNORD41.1-201	ENST00000391000	69 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	AP001318.4-201	ENST00000616637	121 nt	BASIC	0.39	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	AC109327.2-201	ENST00000448339	378 nt	BASIC	0.38	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	Y_RNA.649-201	ENST00000459077	103 nt	BASIC	0.38	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-75P-201	ENST00000515944	104 nt	BASIC	0.38	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-1057P-201	ENST00000517162	102 nt	BASIC	0.38	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	MIR5706-201	ENST00000579841	80 nt	BASIC	0.38	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	MIR6828-201	ENST00000636181	60 nt	BASIC	0.38	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNORD44.1-201	ENST00000363202	61 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNRPGP12-201	ENST00000449481	213 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNORA40.13-201	ENST00000516379	120 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	Y_RNA.705-201	ENST00000516862	110 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	AC073261.1-201	ENST00000429409	121 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU7-74P-201	ENST00000459104	62 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNORA68.3-201	ENST00000515906	83 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-1265P-201	ENST00000516342	103 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	AC025521.1-201	ENST00000621624	286 nt	BASIC	0.37	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	AC090625.1-201	ENST00000357130	210 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	Y_RNA.95-201	ENST00000363079	95 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNORD115-24-201	ENST00000363528	82 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU6-1229P-201	ENST00000364295	107 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	Y_RNA.239-201	ENST00000364444	113 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	Y_RNA.809-201	ENST00000516058	95 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU7-13P-201	ENST00000516413	62 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNU4ATAC9P-201	ENST00000517146	126 nt	BASIC	0.36	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	Y_RNA.190-201	ENST00000363964	101 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNA5SP268-201	ENST00000516828	124 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SCARNA16.5-201	ENST00000517114	183 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	ST7-AS2_1.1-201	ENST00000622900	72 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	MIRLET7F1-201	ENST00000362202	87 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	SNORD116-10-201	ENST00000363791	102 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	RNY4P18-201	ENST00000391107	89 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	AL031737.1-201	ENST00000450125	223 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	snoU13.11-201	ENST00000459219	104 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	MIR4777-201	ENST00000583710	86 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	ZNRD1-AS1_1.6-201	ENST00000610339	68 nt	BASIC	0.35	□□□□□ -2.35
TAF1	P21675	Y_RNA.107-201	ENST00000363190	121 nt	BASIC	0.34	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	Y_RNA.221-201	ENST00000364248	96 nt	BASIC	0.34	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-524P-201	ENST00000384270	107 nt	BASIC	0.34	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR760-201	ENST00000390220	80 nt	BASIC	0.34	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MTATP8P2-201	ENST00000435212	202 nt	BASIC	0.34	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR450A1-201	ENST00000362262	91 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR590-201	ENST00000385008	97 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU7-104P-201	ENST00000459398	79 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	Y_RNA.93-201	ENST00000363066	109 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	AC069271.1-201	ENST00000445577	156 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-795P-201	ENST00000516323	103 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-65P-201	ENST00000516332	98 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	uc_338.10-201	ENST00000621872	182 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR6086-201	ENST00000638065	55 nt	BASIC	0.33	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	SNORA63.4-201	ENST00000362763	126 nt	BASIC	0.32	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MTATP6P29-201	ENST00000415057	132 nt	BASIC	0.32	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR4667-201	ENST00000578933	66 nt	BASIC	0.32	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR3920-201	ENST00000581751	86 nt	BASIC	0.32	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	AC069503.3-201	ENST00000618674	145 nt	BASIC	0.32	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	hsa-mir-4536-1.1-201	ENST00000636519	88 nt	BASIC	0.31	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-766P-201	ENST00000362478	107 nt	BASIC	0.31	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-35P-201	ENST00000384530	107 nt	BASIC	0.31	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	SNORD110-201	ENST00000408189	75 nt	BASIC	0.31	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-287P-201	ENST00000516230	98 nt	BASIC	0.31	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	uc_338.28-201	ENST00000612082	187 nt	BASIC	0.31	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	Y_RNA.207-201	ENST00000364142	106 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-215P-201	ENST00000365169	102 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNY4P3-201	ENST00000365254	95 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR329-2-201	ENST00000385029	84 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-269P-201	ENST00000391077	97 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	AL353813.1-201	ENST00000440700	253 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	Y_RNA.648-201	ENST00000459455	110 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-904P-201	ENST00000516206	101 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR7107-201	ENST00000611489	80 nt	BASIC	0.3	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-466P-201	ENST00000391224	103 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR1302-5-201	ENST00000408164	150 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNY4P30-201	ENST00000410216	95 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	AC069113.3-201	ENST00000521019	150 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	DLEU2_3.1-201	ENST00000620005	73 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	Y_RNA.125-201	ENST00000363371	111 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	SNORD101-201	ENST00000384027	73 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	MIR519E-201	ENST00000385075	84 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU7-85P-201	ENST00000458851	63 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	SNORD4B-201	ENST00000459083	72 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	AC012531.4-201	ENST00000616509	177 nt	BASIC	0.29	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-755P-201	ENST00000364400	103 nt	BASIC	0.28	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-756P-201	ENST00000383997	107 nt	BASIC	0.28	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	Y_RNA.544-201	ENST00000384650	113 nt	BASIC	0.28	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-1052P-201	ENST00000411398	104 nt	BASIC	0.28	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	AL161932.1-201	ENST00000437408	146 nt	BASIC	0.28	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	RNU6-719P-201	ENST00000516671	104 nt	BASIC	0.28	□□□□□ -2.36
TAF1	P21675	SNORA51.5-201	ENST00000384126	131 nt	BASIC	0.27	□□□□□ -2.37

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