Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
J3KRW8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
J3KRW8 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
J3KRW8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
J3KRW8 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
J3KRW8 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
J3KRW8 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
J3KRW8 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
J3KRW8 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
J3KRW8 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
J3KRW8 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
J3KRW8 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
J3KRW8 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
J3KRW8 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
J3KRW8 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
J3KRW8 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
J3KRW8 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
J3KRW8 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
J3KRW8 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
J3KRW8 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
J3KRW8 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
J3KRW8 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
J3KRW8 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
J3KRW8 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
J3KRW8 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
J3KRW8 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
J3KRW8 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
J3KRW8 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
J3KRW8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
J3KRW8 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
J3KRW8 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
J3KRW8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
J3KRW8 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
J3KRW8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
J3KRW8 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
J3KRW8 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
J3KRW8 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
J3KRW8 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
J3KRW8 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
J3KRW8 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
J3KRW8 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
J3KRW8 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
J3KRW8 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
J3KRW8 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
J3KRW8 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
J3KRW8 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
J3KRW8 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
J3KRW8 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
J3KRW8 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
J3KRW8 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
J3KRW8 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
J3KRW8 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
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