Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SH3BP4Q9P0V3 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SH3BP4Q9P0V3 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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