Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRAPPC9Q96Q05 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.9 ms