Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TOP1MTQ969P6 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
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