Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SWI5Q1ZZU3 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SWI5Q1ZZU3 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SWI5Q1ZZU3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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