Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ME3Q16798 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ME3Q16798 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ME3Q16798 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ME3Q16798 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ME3Q16798 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ME3Q16798 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ME3Q16798 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ME3Q16798 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ME3Q16798 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ME3Q16798 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ME3Q16798 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ME3Q16798 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ME3Q16798 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ME3Q16798 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ME3Q16798 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ME3Q16798 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ME3Q16798 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ME3Q16798 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ME3Q16798 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ME3Q16798 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ME3Q16798 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ME3Q16798 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ME3Q16798 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ME3Q16798 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ME3Q16798 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ME3Q16798 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ME3Q16798 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ME3Q16798 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ME3Q16798 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ME3Q16798 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ME3Q16798 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.3 ms