Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
HIF1AQ16665 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HIF1AQ16665 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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