Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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VPS72Q15906 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
VPS72Q15906 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VPS72Q15906 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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