Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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SHHQ15465 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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SHHQ15465 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SHHQ15465 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SHHQ15465 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHHQ15465 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SHHQ15465 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHHQ15465 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHHQ15465 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHHQ15465 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHHQ15465 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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