Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NR1I3Q14994 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NR1I3Q14994 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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