Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
GBX1Q14549 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GBX1Q14549 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms