Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD9Q14511 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD9Q14511 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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