Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms