Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1SQ13698 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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