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Protein–RNA interactions for Protein: Q13620
CUL4B, Cullin-4B, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4B
Q13620
SNORD33.1-201
ENST00000516213
88 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-1265P-201
ENST00000516342
103 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
AC068339.1-201
ENST00000526965
141 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
AL035470.1-201
ENST00000622571
220 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
SNORD115-44-201
ENST00000365391
82 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6ATAC4P-201
ENST00000387446
126 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
AC008267.6-201
ENST00000441664
139 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR3920-201
ENST00000581751
86 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
U7.6-201
ENST00000610841
64 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
HOTAIR_3.1-201
ENST00000611352
97 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
KIF20B-201
ENST00000260753
6306 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-509P-201
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107 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
SNORD114-26-201
ENST00000363543
72 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNA5SP128-201
ENST00000365305
116 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
Y_RNA.353-201
ENST00000365440
108 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
Y_RNA.540-201
ENST00000384638
111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR548A1-201
ENST00000385041
97 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR760-201
ENST00000390220
80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
AL357793.1-201
ENST00000448412
401 nt
TSL 5
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-1333P-201
ENST00000516162
93 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR577-201
ENST00000385196
96 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-269P-201
ENST00000391077
97 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR1273G-201
ENST00000577677
100 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU1-29P-201
ENST00000606574
126 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR924-201
ENST00000638017
53 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNY3P2-201
ENST00000362918
102 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-1125P-201
ENST00000363601
107 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-480P-201
ENST00000384332
107 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
Y_RNA.549-201
ENST00000384657
102 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
SNORA62.5-201
ENST00000516634
120 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR5009-201
ENST00000578736
100 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR4752-201
ENST00000579672
72 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
MIR4514-201
ENST00000581410
57 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
ST7-AS2_1.1-201
ENST00000622900
72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-832P-201
ENST00000363319
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
SNORA42.1-201
ENST00000363515
137 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
Y_RNA.281-201
ENST00000364774
94 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
U8.6-201
ENST00000364939
135 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
RNU6-412P-201
ENST00000516434
106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
CUL4B
Q13620
Y_RNA.466-201
ENST00000384294
113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNU6-880P-201
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107 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
MIR4439-201
ENST00000583746
80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNA5SP299-201
ENST00000391203
116 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
uc_338.28-201
ENST00000612082
187 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNU6-1163P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
AC141557.1-201
ENST00000540982
400 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
AC023932.2-201
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175 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
MIR330-201
ENST00000362196
94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
Y_RNA.10-201
ENST00000362371
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
Y_RNA.205-201
ENST00000364128
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
SNORD116-21-201
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92 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
MIR1295A-201
ENST00000408463
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNU7-129P-201
ENST00000516128
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BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
SNORA70.25-201
ENST00000612741
95 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
MIR8087-201
ENST00000612745
78 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
MIR617-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNU6-127P-201
ENST00000390897
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
SNORD45B-201
ENST00000364617
72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNU6-652P-201
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107 nt
BASIC
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CUL4B
Q13620
Y_RNA.596-201
ENST00000410462
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
Y_RNA.659-201
ENST00000515994
113 nt
BASIC
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CUL4B
Q13620
RNU6-62P-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNU6-782P-201
ENST00000516852
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
MIR4743-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
MIR6779-201
ENST00000617283
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BASIC
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□□□□□ -2.39
CUL4B
Q13620
RNA5SP214-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
Y_RNA.261-201
ENST00000364631
102 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-1117P-201
ENST00000384525
104 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MIR7-2-201
ENST00000384970
110 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MIR610-201
ENST00000385139
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-466P-201
ENST00000391224
103 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MIR892B-201
ENST00000401279
77 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
SNORD110-201
ENST00000408189
75 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
AC006210.1-201
ENST00000424882
111 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-1244P-201
ENST00000363614
108 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU4-36P-201
ENST00000364294
144 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
SNORD114-9-201
ENST00000364370
72 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-1232P-201
ENST00000516299
86 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MIR499B-201
ENST00000636498
73 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-834P-201
ENST00000362367
110 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
Y_RNA.78-201
ENST00000362970
110 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU1-141P-201
ENST00000364623
158 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-1014P-201
ENST00000383940
103 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MIR181B2-201
ENST00000385004
89 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MIR501-201
ENST00000390204
84 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
AC109327.2-201
ENST00000448339
378 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
AC079760.1-201
ENST00000456952
202 nt
TSL 3
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNA5SP484-201
ENST00000458857
111 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
Y_RNA.660-201
ENST00000516002
120 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
NAMPTP3-201
ENST00000569273
224 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MTRNR2L2-201
ENST00000604882
87 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
AL365222.1-201
ENST00000614661
98 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
MIR6718-201
ENST00000616153
80 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
AC132825.6-201
ENST00000638861
357 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-1107P-201
ENST00000364817
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
CUL4B
Q13620
RNU6-1144P-201
ENST00000384247
104 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
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