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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
AC007012.1-201
ENST00000567192
175 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
YWHAEP2-201
ENST00000580066
112 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR4473-201
ENST00000583731
91 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
AC021753.1-201
ENST00000635724
168 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.29-201
ENST00000362570
113 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-363P-201
ENST00000362895
105 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.173-201
ENST00000363776
113 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-379P-201
ENST00000363813
104 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
SNORD38.1-201
ENST00000363863
68 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNA5SP205-201
ENST00000364653
136 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
SNORD114-29-201
ENST00000364819
70 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
SNORA51.5-201
ENST00000384126
131 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.552-201
ENST00000384665
112 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR548D2-201
ENST00000384955
97 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR196A2-201
ENST00000385189
110 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR759-201
ENST00000390224
91 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-243P-201
ENST00000391140
107 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.596-201
ENST00000410462
109 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR4460-201
ENST00000577862
86 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
G3BP1-214
ENST00000627077
114 nt
TSL 5
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-151P-201
ENST00000364158
107 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
U8.6-201
ENST00000364939
135 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
AL353813.1-201
ENST00000440700
253 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR8064-201
ENST00000612863
90 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.57-201
ENST00000362806
113 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNA5SP98-201
ENST00000363158
137 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.188-201
ENST00000363952
111 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.391-201
ENST00000383933
94 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR513C-201
ENST00000401352
84 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR548G-201
ENST00000408442
89 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6ATAC23P-201
ENST00000408448
123 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-735P-201
ENST00000410612
107 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-394P-201
ENST00000410735
107 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU4ATAC4P-201
ENST00000516307
126 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
AP001328.1-201
ENST00000528550
176 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR548AE1-201
ENST00000583292
70 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
ST7-AS2_1.1-201
ENST00000622900
72 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
U6.100-201
ENST00000636230
99 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR4788-201
ENST00000639104
80 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR539-201
ENST00000365690
78 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.407-201
ENST00000383986
113 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-175P-201
ENST00000516896
107 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-90P-201
ENST00000606352
106 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
AL590491.3-201
ENST00000610731
82 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Evf-2_5p.1-201
ENST00000614213
142 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.207-201
ENST00000364142
106 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
SNORA7.5-201
ENST00000410672
110 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
COX7A2-206
ENST00000472311
325 nt
TSL 2
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-1234P-201
ENST00000516877
103 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-1271P-201
ENST00000517049
105 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
U7.2-201
ENST00000607576
63 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
MIR548AZ-201
ENST00000616567
95 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
FTX_2.1-201
ENST00000618816
94 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.215-201
ENST00000364204
112 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-1130P-201
ENST00000365434
107 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
SNORA32.3-201
ENST00000384772
121 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
MIR216B-201
ENST00000390186
82 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
AL158147.1-201
ENST00000443970
75 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
SPINT5P-201
ENST00000448174
155 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
AC074198.2-201
ENST00000508153
258 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNA5SP285-201
ENST00000516619
119 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
MIR548X2-201
ENST00000579776
100 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
MIR4645-201
ENST00000583158
77 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
AC004792.1-201
ENST00000614523
137 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
uc_338.36-201
ENST00000622331
158 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-235P-201
ENST00000362644
107 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.78-201
ENST00000362970
110 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
SNORD114-31-201
ENST00000363219
75 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
SNORD114-28-201
ENST00000363610
72 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.247-201
ENST00000364500
92 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-154P-201
ENST00000384306
106 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-284P-201
ENST00000411105
106 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
AL512310.12-203
ENST00000640543
90 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
CCDC7-215
ENST00000639629
4158 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
SNORD114-11-201
ENST00000363738
75 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
SNORD116-18-201
ENST00000383961
92 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.420-201
ENST00000384043
110 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
MIR1263-201
ENST00000408324
86 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
IGLVI-20-201
ENST00000519296
130 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-957P-201
ENST00000363652
99 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.294-201
ENST00000364916
102 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.344-201
ENST00000365381
112 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-409P-201
ENST00000384114
104 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU6-1144P-201
ENST00000384247
104 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
Y_RNA.528-201
ENST00000384575
108 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
AL161932.1-201
ENST00000437408
146 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
RNU5B-6P-201
ENST00000516765
68 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
CUL1
Q13616
MIR20A-201
ENST00000362279
71 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNY4P6-201
ENST00000363667
96 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
Y_RNA.377-201
ENST00000365644
108 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
Y_RNA.507-201
ENST00000384500
99 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
AC244090.1-201
ENST00000441884
93 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-388P-201
ENST00000517012
105 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-389P-201
ENST00000517048
105 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
AL442128.1-201
ENST00000615151
90 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
Y_RNA.400-201
ENST00000383963
111 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-480P-201
ENST00000384332
107 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
MIR569-201
ENST00000385228
96 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RNU6-466P-201
ENST00000391224
103 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CUL1
Q13616
RPS29P8-201
ENST00000445109
171 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
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