Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TUBB3Q13509 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TUBB3Q13509 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TUBB3Q13509 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TUBB3Q13509 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TUBB3Q13509 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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