Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TCIRG1Q13488 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TCIRG1Q13488 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms