Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
AP3B2Q13367 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
AP3B2Q13367 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
AP3B2Q13367 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
AP3B2Q13367 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
AP3B2Q13367 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
AP3B2Q13367 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
AP3B2Q13367 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
AP3B2Q13367 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
AP3B2Q13367 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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