Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ATMQ13315 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ATMQ13315 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ATMQ13315 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ATMQ13315 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ATMQ13315 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ATMQ13315 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ATMQ13315 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ATMQ13315 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-2.85□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ATMQ13315 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ATMQ13315 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ATMQ13315 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.87□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ATMQ13315 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ATMQ13315 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ATMQ13315 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.9□□□□□ -2.87
ATMQ13315 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ATMQ13315 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ATMQ13315 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ATMQ13315 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
ATMQ13315 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-2.91□□□□□ -2.87
ATMQ13315 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
ATMQ13315 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ATMQ13315 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
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