Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3BQ13214 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3BQ13214 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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