Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXD4Q12950 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
FOXD4Q12950 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
FOXD4Q12950 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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