Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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FOXF2Q12947 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF2Q12947 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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