Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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RAB40BQ12829 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB40BQ12829 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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RAB40BQ12829 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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RAB40BQ12829 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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RAB40BQ12829 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
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RAB40BQ12829 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RAB40BQ12829 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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