Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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PGGT1BP53609 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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PGGT1BP53609 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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PGGT1BP53609 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PGGT1BP53609 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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PGGT1BP53609 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
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PGGT1BP53609 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PGGT1BP53609 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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PGGT1BP53609 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PGGT1BP53609 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PGGT1BP53609 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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PGGT1BP53609 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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PGGT1BP53609 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
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PGGT1BP53609 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
PGGT1BP53609 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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