Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PRPF6O94906 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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PRPF6O94906 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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PRPF6O94906 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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PRPF6O94906 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRPF6O94906 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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PRPF6O94906 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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PRPF6O94906 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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PRPF6O94906 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF6O94906 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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