Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CTIFO43310 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CTIFO43310 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CTIFO43310 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CTIFO43310 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CTIFO43310 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CTIFO43310 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CTIFO43310 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CTIFO43310 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CTIFO43310 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CTIFO43310 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CTIFO43310 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CTIFO43310 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CTIFO43310 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CTIFO43310 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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