Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PJA2O43164 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PJA2O43164 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PJA2O43164 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PJA2O43164 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PJA2O43164 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PJA2O43164 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PJA2O43164 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PJA2O43164 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PJA2O43164 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PJA2O43164 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PJA2O43164 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PJA2O43164 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PJA2O43164 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PJA2O43164 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PJA2O43164 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PJA2O43164 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PJA2O43164 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PJA2O43164 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PJA2O43164 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PJA2O43164 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PJA2O43164 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PJA2O43164 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PJA2O43164 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PJA2O43164 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PJA2O43164 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PJA2O43164 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PJA2O43164 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PJA2O43164 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PJA2O43164 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PJA2O43164 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PJA2O43164 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PJA2O43164 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PJA2O43164 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.2 ms