Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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