Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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