Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SMG1Q96Q15 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SMG1Q96Q15 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms