Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSC4DQ8WTU2 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSC4DQ8WTU2 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SSC4DQ8WTU2 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SSC4DQ8WTU2 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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