Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
BEST4Q8NFU0 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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BEST4Q8NFU0 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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BEST4Q8NFU0 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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BEST4Q8NFU0 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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BEST4Q8NFU0 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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BEST4Q8NFU0 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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BEST4Q8NFU0 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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BEST4Q8NFU0 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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