Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NLRC3Q7RTR2 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NLRC3Q7RTR2 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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