Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.6 ms