Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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PKN1Q16512 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PKN1Q16512 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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PKN1Q16512 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PKN1Q16512 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PKN1Q16512 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PKN1Q16512 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PKN1Q16512 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PKN1Q16512 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PKN1Q16512 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PKN1Q16512 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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PKN1Q16512 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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