Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC1Q15751 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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