Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIV2LQ15477 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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