Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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PTPRKQ15262 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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PTPRKQ15262 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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PTPRKQ15262 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PTPRKQ15262 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRKQ15262 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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PTPRKQ15262 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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PTPRKQ15262 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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PTPRKQ15262 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRKQ15262 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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