Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX17Q15036 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SNX17Q15036 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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SNX17Q15036 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX17Q15036 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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SNX17Q15036 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SNX17Q15036 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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SNX17Q15036 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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