Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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