Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CAPSQ13938 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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CAPSQ13938 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
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CAPSQ13938 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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CAPSQ13938 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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CAPSQ13938 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CAPSQ13938 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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CAPSQ13938 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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CAPSQ13938 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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CAPSQ13938 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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CAPSQ13938 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CAPSQ13938 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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