Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RUNX3Q13761 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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RUNX3Q13761 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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RUNX3Q13761 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RUNX3Q13761 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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