Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HDAC1Q13547 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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