Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMAD4Q13485 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMAD4Q13485 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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