Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF1Q13351 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KLF1Q13351 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KLF1Q13351 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF1Q13351 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KLF1Q13351 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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