Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
IFT88Q13099 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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IFT88Q13099 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IFT88Q13099 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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