Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXF2Q12947 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXF2Q12947 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXF2Q12947 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.5 ms