Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPN13Q12923 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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